Климат в Малайзии тропический, здесь тепло и влажно круглый год. Среднегодовая температура колеблется от 26°С до 30°С, несколько прохладней в высокогорье . Наиболее прохладным считается время с ноября по январь. Муссонные ветра распределяются следующим образом: на юго-западе с апреля по октябрь, на северо-востоке страны с октября по февраль. На побережье температура в течение года мало изменяется и колеблется от 22° до 32°С. Для западного побережья период с сентября по декабрь характеризуется краткими тропическими ливнями, сменяющимися солнечной погодой. Для восточного побережья этот период длится с октября по февраль.
Сезонных изменений климата практически нет. В период муссонов только на северо-восточном побережье Малакки возможно прекращение морского туризма. В иное время сильные ветры редки.

Температура воды: на глубине средняя температура составляет 25°C в прохладный сезон и 31°C - в теплый. На мелководье - в среднем 30°С.
В Малайзии нет ярко выраженного сезона дождей. Дожди обычно проходят во второй половине дня. Таким образом, Малайзия привлекательна для туристов круглый год. Украшенная постоянным летом, невероятно богатой флорой и фауной , многонациональной культурой Малайзия предлагает туристам восторги тропического праздника в сочетании с блаженством восточного комфорта.
Среднегодовая сумма осадков на равнинах составляет 1500–2500 мм в полуостровной части страны и 3750 мм на о.Калимантан, повышаясь в горах до 4000–5000 мм. Осадки выпадают круглый год, но в результате чередования северо-восточного и юго-западного муссонов обнаруживают сезонную изменчивость (самый дождливый месяц декабрь, а с февраля по июнь осадки менее обильны). В целом в Сараваке и на восточном побережье Полуостровной Малайзии ненастная погода бывает чаще, чем на ее западном побережье и в Сабахе. Максимальное годовое количество влаги зафиксировано в местечке Лонг-Атар в Сараваке (6000 мм).